长达五百年的教会和魔女的对立和几年前成立的和平然而在这阴影之下，矛盾的残渣还残留在世界各地 。在维尼亚斯王国的魔法学校就学的被淘汰的学生赛比鲁，失去了上学前的记忆。这样的他，在阿尔巴斯校长的命令下，离开王国，踏入反魔女派势力强大的大陆南部进行特别实习。与他同行的是寻找魔法之始的 禁书零之书 来阅览的黎明之魔女洛?克里斯塔斯和秀才少女霍尔特，以及蜥蜴兽化者库多，他们都是有强烈个性的人。